橘小实蝇完整基因组图谱发布

　　12月19日从中国农业科学院获悉，该院深圳农业基因组研究所（岭南现代农业科学与技术广东省实验室深圳分中心）研究员王桂荣课题组联合研究员崔鹏课题组成功构建“果蔬杀手”橘小实蝇最完整基因组图谱。相关研究成果于近日发表在国际期刊《自然·通讯》上。

　　橘小实蝇因食性杂、寄主广、繁殖力强，被称为果蔬界的“头号杀手”。其高质量的基因组图谱，为开发新的害虫绿色防治手段提供了重要资源。

　　近年来，研究人员陆续发布了多个橘小实蝇基因组版本。然而，这些基因组大多基于混合个体组装，尤其是在橘小实蝇中心粒（细胞分裂和环境适应的关键结构）、性染色体等富含重复的基因序列区域有较多“盲区”。

　　王桂荣介绍，研究团队综合利用多种三代测序技术，以单个体雄虫的测序数据为基础，整合群体数据，成功组装出了大小近600Mb的基因组。

　　与其他橘小实蝇基因组参考版本相比，新的基因组图谱首次实现了从端粒到端粒的无缺口完整覆盖。“比如，新的基因组图谱覆盖了染色体末端的端粒结构和在细胞分裂中起关键作用的着丝粒区域，还包含了大量重复序列的Y染色体全序列。借助这些新序列，研究人员可以识别出多个以往未发现的串联重复基因簇，尤其是气味受体基因家族。这些基因可能在橘小实蝇识别寄主、适应环境的过程中发挥着重要作用。”王桂荣说。

　　“该项研究为害虫绿色防控提供了高质量的参考基因组资源。”崔鹏说。